Ardından pilot tuvalete girmek için kokpitten çıkıyor. Kara kutu kayıtlarında, o sırada El-Batuti’nin kısık bir sesle “Allah’ım sana güveniyorum” dediği duyuluyor. El-Batuti, uçağı otomatik pilottan manuele alıyor ve yere doğru sürüyor. Uçak düştükçe “Allah’ım sana güveniyorum” demeye devam ediyor. Kaptan kokpite geri döndüğünde çok geç oluyor. ABD Ulusal Ulaşım Güvenliği Kurumu, uçağın düşmesinin sebebini büyük olasılıkla El-Batuti’nin hareketleri olarak belirtse de Mısır’dan gelen açıklamada sebep mekanik bir hata olarak gösterildi. Kopilotun intihar edip etmediği kesinleşmedi.
